Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms