Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLDN15P56746 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms