Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASP9P55211 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms