Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PGGT1BP53609 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PGGT1BP53609 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PGGT1BP53609 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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PGGT1BP53609 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PGGT1BP53609 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PGGT1BP53609 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PGGT1BP53609 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PGGT1BP53609 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PGGT1BP53609 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PGGT1BP53609 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PGGT1BP53609 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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