Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERFP50548 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERFP50548 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERFP50548 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms