Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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CENPFP49454 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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CENPFP49454 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CENPFP49454 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CENPFP49454 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CENPFP49454 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CENPFP49454 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CENPFP49454 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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CENPFP49454 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPFP49454 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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CENPFP49454 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPFP49454 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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CENPFP49454 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPFP49454 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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CENPFP49454 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPFP49454 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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CENPFP49454 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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CENPFP49454 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CENPFP49454 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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CENPFP49454 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPFP49454 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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