Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJA8P48165 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJA8P48165 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GJA8P48165 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms