Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
XCR1P46094 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
XCR1P46094 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms