Protein–RNA interactions for Protein: P40123

CAP2, Adenylyl cyclase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP2P40123 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CAP2P40123 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAP2P40123 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAP2P40123 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms