Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LTBRP36941 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms