Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNA1P35221 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms