Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GPC1P35052 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPC1P35052 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC1P35052 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms