Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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CASQ1P31415 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASQ1P31415 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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