Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms