Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CRABP1P29762 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms