Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
APCP25054 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
APCP25054 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
APCP25054 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
APCP25054 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
APCP25054 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
APCP25054 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
APCP25054 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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APCP25054 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
APCP25054 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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APCP25054 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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APCP25054 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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