Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD247P20963 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD247P20963 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD247P20963 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD247P20963 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms