Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms