Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP4AP20648 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms