Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B1P20020 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms