Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM21P19474 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM21P19474 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms