Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HPGDP15428 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HPGDP15428 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HPGDP15428 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HPGDP15428 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HPGDP15428 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HPGDP15428 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HPGDP15428 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HPGDP15428 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HPGDP15428 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms