Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RLBP1P12271 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RLBP1P12271 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms