Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNAP12004 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNAP12004 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNAP12004 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNAP12004 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNAP12004 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNAP12004 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNAP12004 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNAP12004 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNAP12004 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNAP12004 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNAP12004 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCNAP12004 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCNAP12004 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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