Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYBBP04839 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYBBP04839 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYBBP04839 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYBBP04839 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYBBP04839 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYBBP04839 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYBBP04839 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYBBP04839 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYBBP04839 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYBBP04839 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYBBP04839 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms