Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C6orf47O95873 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms