Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBXN7O94888 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms