Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DCTN3O75935 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms