Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF4O60810 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms