Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRICKLE3O43900 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms