Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SLC25A20O43772 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms