Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXO3O43524 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms