Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms