Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms