Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RGPD3A6NKT7 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms