Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms