Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNPO3Q9Y5L0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms