Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AFG3L2Q9Y4W6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms