Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TMED7Q9Y3B3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms