Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX6Q9UNH7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX6Q9UNH7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms