Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCDHA12Q9UN75 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms