Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MKLN1Q9UL63 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms