Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF11Q9UIL8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms