Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GTF2IRD1Q9UHL9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF2IRD1Q9UHL9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms