Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ABCF2Q9UG63 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ABCF2Q9UG63 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms