Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
REREQ9P2R6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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