Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MKS1Q9NXB0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MKS1Q9NXB0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms