Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SLC39A9Q9NUM3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SLC39A9Q9NUM3 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms