Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms