Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBQLN4Q9NRR5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBQLN4Q9NRR5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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